Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK5

TSHZ3, Teashirt homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ3Q63HK5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TSHZ3Q63HK5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms