Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM208BQ5VWN6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms