Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms