Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM164Q5U3C3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM164Q5U3C3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM164Q5U3C3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM164Q5U3C3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM164Q5U3C3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM164Q5U3C3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM164Q5U3C3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM164Q5U3C3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM164Q5U3C3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM164Q5U3C3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms