Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms