Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms