Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
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