Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms