Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms