Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms