Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms