Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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EXT1Q16394 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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EXT1Q16394 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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EXT1Q16394 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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EXT1Q16394 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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EXT1Q16394 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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EXT1Q16394 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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EXT1Q16394 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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EXT1Q16394 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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