Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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SNCBQ16143 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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SNCBQ16143 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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