Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
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GRIK4Q16099 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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GRIK4Q16099 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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GRIK4Q16099 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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