Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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