Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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RYR3Q15413 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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RYR3Q15413 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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RYR3Q15413 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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RYR3Q15413 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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RYR3Q15413 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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RYR3Q15413 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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RYR3Q15413 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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RYR3Q15413 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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