Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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