Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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