Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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