Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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CDH18Q13634 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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CDH18Q13634 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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CDH18Q13634 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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CDH18Q13634 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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CDH18Q13634 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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CDH18Q13634 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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