Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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TOP3AQ13472 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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