Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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