Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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ITGB3BPQ13352 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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ITGB3BPQ13352 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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ITGB3BPQ13352 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3BPQ13352 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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