Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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