Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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TRAF1Q13077 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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TRAF1Q13077 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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TRAF1Q13077 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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