Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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FOXC1Q12948 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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FOXC1Q12948 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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FOXC1Q12948 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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FOXC1Q12948 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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FOXC1Q12948 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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FOXC1Q12948 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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FOXC1Q12948 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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FOXC1Q12948 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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