Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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