Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SREBF2Q12772 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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