Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms