Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms