Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms