Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms