Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms