Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms