Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA3P59666 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms