Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA1P59665 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms