Protein–RNA interactions for Protein: P58546

MTPN, Myotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTPNP58546 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MTPNP58546 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MTPNP58546 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MTPNP58546 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTPNP58546 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTPNP58546 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTPNP58546 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTPNP58546 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTPNP58546 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTPNP58546 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTPNP58546 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTPNP58546 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTPNP58546 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTPNP58546 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MTPNP58546 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTPNP58546 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTPNP58546 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTPNP58546 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTPNP58546 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MTPNP58546 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTPNP58546 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTPNP58546 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTPNP58546 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTPNP58546 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTPNP58546 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTPNP58546 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTPNP58546 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTPNP58546 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MTPNP58546 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTPNP58546 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MTPNP58546 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTPNP58546 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTPNP58546 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTPNP58546 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms