Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms