Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC12A2P55011 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms