Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HIRAP54198 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIRAP54198 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIRAP54198 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HIRAP54198 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIRAP54198 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HIRAP54198 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIRAP54198 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIRAP54198 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIRAP54198 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HIRAP54198 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIRAP54198 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HIRAP54198 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIRAP54198 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIRAP54198 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIRAP54198 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIRAP54198 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HIRAP54198 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HIRAP54198 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIRAP54198 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HIRAP54198 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HIRAP54198 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HIRAP54198 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HIRAP54198 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HIRAP54198 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIRAP54198 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HIRAP54198 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HIRAP54198 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIRAP54198 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIRAP54198 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIRAP54198 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIRAP54198 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIRAP54198 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HIRAP54198 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIRAP54198 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIRAP54198 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HIRAP54198 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HIRAP54198 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HIRAP54198 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIRAP54198 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HIRAP54198 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HIRAP54198 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HIRAP54198 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIRAP54198 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HIRAP54198 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIRAP54198 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIRAP54198 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HIRAP54198 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HIRAP54198 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIRAP54198 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIRAP54198 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HIRAP54198 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HIRAP54198 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HIRAP54198 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIRAP54198 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIRAP54198 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HIRAP54198 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HIRAP54198 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HIRAP54198 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HIRAP54198 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HIRAP54198 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HIRAP54198 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HIRAP54198 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIRAP54198 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIRAP54198 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HIRAP54198 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIRAP54198 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIRAP54198 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIRAP54198 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms