Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF6P49848 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF6P49848 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF6P49848 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF6P49848 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF6P49848 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF6P49848 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF6P49848 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF6P49848 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF6P49848 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF6P49848 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF6P49848 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF6P49848 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF6P49848 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF6P49848 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF6P49848 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF6P49848 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF6P49848 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF6P49848 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF6P49848 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF6P49848 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF6P49848 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF6P49848 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF6P49848 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF6P49848 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF6P49848 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF6P49848 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF6P49848 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF6P49848 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF6P49848 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF6P49848 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF6P49848 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF6P49848 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF6P49848 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF6P49848 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF6P49848 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms