Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A3P48764 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A3P48764 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A3P48764 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC9A3P48764 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC9A3P48764 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC9A3P48764 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC9A3P48764 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC9A3P48764 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC9A3P48764 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC9A3P48764 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC9A3P48764 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC9A3P48764 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms