Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX1P48742 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX1P48742 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX1P48742 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX1P48742 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX1P48742 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX1P48742 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX1P48742 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX1P48742 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX1P48742 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX1P48742 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX1P48742 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX1P48742 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX1P48742 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX1P48742 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX1P48742 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX1P48742 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX1P48742 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX1P48742 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX1P48742 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX1P48742 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX1P48742 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX1P48742 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX1P48742 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX1P48742 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX1P48742 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX1P48742 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX1P48742 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX1P48742 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX1P48742 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX1P48742 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX1P48742 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX1P48742 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX1P48742 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX1P48742 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX1P48742 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX1P48742 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX1P48742 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX1P48742 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX1P48742 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX1P48742 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX1P48742 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX1P48742 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX1P48742 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms