Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNT2P45379 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT2P45379 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms