Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECI1P42126 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECI1P42126 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms