Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms