Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPB2P35606 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPB2P35606 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPB2P35606 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPB2P35606 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
COPB2P35606 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPB2P35606 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
COPB2P35606 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPB2P35606 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPB2P35606 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPB2P35606 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPB2P35606 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPB2P35606 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPB2P35606 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
COPB2P35606 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPB2P35606 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPB2P35606 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPB2P35606 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPB2P35606 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
COPB2P35606 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPB2P35606 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPB2P35606 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPB2P35606 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPB2P35606 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
COPB2P35606 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPB2P35606 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPB2P35606 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPB2P35606 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPB2P35606 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPB2P35606 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPB2P35606 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPB2P35606 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPB2P35606 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPB2P35606 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
COPB2P35606 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPB2P35606 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPB2P35606 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPB2P35606 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPB2P35606 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPB2P35606 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPB2P35606 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPB2P35606 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPB2P35606 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPB2P35606 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPB2P35606 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPB2P35606 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPB2P35606 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPB2P35606 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPB2P35606 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPB2P35606 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPB2P35606 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPB2P35606 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPB2P35606 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPB2P35606 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPB2P35606 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPB2P35606 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPB2P35606 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPB2P35606 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPB2P35606 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COPB2P35606 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COPB2P35606 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
COPB2P35606 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
COPB2P35606 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COPB2P35606 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COPB2P35606 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COPB2P35606 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COPB2P35606 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
COPB2P35606 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COPB2P35606 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
COPB2P35606 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COPB2P35606 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
COPB2P35606 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COPB2P35606 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPB2P35606 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPB2P35606 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPB2P35606 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPB2P35606 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPB2P35606 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPB2P35606 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPB2P35606 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPB2P35606 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPB2P35606 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPB2P35606 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPB2P35606 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPB2P35606 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPB2P35606 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPB2P35606 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPB2P35606 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPB2P35606 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPB2P35606 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPB2P35606 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPB2P35606 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
COPB2P35606 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPB2P35606 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPB2P35606 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPB2P35606 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPB2P35606 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPB2P35606 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPB2P35606 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPB2P35606 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms