Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA9P31269 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
HOXA9P31269 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
HOXA9P31269 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms