Protein–RNA interactions for Protein: P30926

CHRNB4, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB4P30926 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB4P30926 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms