Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms